Efternavnet Pedersen er et klassisk nordisk patronym (et fadersnavn), hvis direkte sproglige betydning er "søn af Peder". Navnet er opbygget af det traditionelle mandsnavn Peder samt den patronymiske endelse -sen. Fornavnet Peder (og varianten Peter) har sine rødder i det græske navn Petros (via latin Petrus), der er afledt af ordet petra, som betyder "klippe" eller "sten". Navnet fik en monumental udbredelse i hele den kristne verden og i Norden i middelalderen på grund af apostlen og disciplen Peter, som i Det Nye Testamente omtales som den klippe, kirken skulle bygges på.
Navnet Pedersen har historisk set haft en enorm geografisk udbredelse over hele det danske landområde på grund af det gamle nordiske patronymsystem. I landbosamfundet skiftede efternavnet i hver generation, hvilket betød, at børn af en mand ved navn Peder fik efternavnet Pedersen (for sønner) eller Pederstatter/Pedersdatter (for døtre). Denne dynamiske navngivningspraksis skabte store administrative udfordringer for den danske stat i forhold til skatteopkrævning, skifteprotokoller og militærudskrivning. For at ensrette systemet udstedte staten Navnelovene i 1828 og 1853, som påbød befolkningen at fastlåse deres efternavne permanent. Selvom lovgivningen stødte på stor folkelig modstand og tog årtier om at slå helt igennem på landet, medførte den, at Pedersen stivnede som et fast, arveligt slægtsnavn i midten af 1800-tallet.
I det moderne Danmark er efternavnet Pedersen et af de absolut mest udbredte og hyppige efternavne i befolkningen. Det optræder stabilt i top 5 over Danmarks mest anvendte efternavne og bæres af over 110.000 borgere ifølge officielle opgørelser fra Danmarks Statistik. Da antallet af navnebærere ligger langt over den juridiske og lovmæssige grænse på 2.000 personer, kategoriseres Pedersen som et frit efternavn, hvilket betyder, at enhver dansk borger frit kan antage navnet uden administrative krav om slægtsmæssig tilknytning.
Historien rummer mange markante og veldokumenterede danskere med efternavnet Pedersen. Blandt de mest indflydelsesrige skikkelser i historiebøgerne finder man:
Navnet optræder hos 6.421 personer.