Efternavnet Jakobsen (historisk set også meget hyppigt stavet Jacobsen) er et klassisk nordisk patronymikon (et fadersnavn), der ordret betyder "søn af Jakob". Det tilgrundliggende mandsnavn Jakob rækker etymologisk tilbage til det bibelske, hebraiske navn Ya'aqov (יַעֲקֹב). Navnet bærer den direkte betydning "den, der holder om hælen" eller metaforisk "bortdriver", hvilket refererer til den bibelske fortælling i Genesis om patriarken Jakob, der blev født holdende om sin tvillingebror Esaus hæl. Navnet opnåede en monumental udbredelse i hele Europa i middelalderen via den latinske form Iacobus på grund af de nytestamentlige skikkelser apostlen Jakob den Ældre og apostlen Jakob den Yngre, hvilket dannede det sproglige fundament for efternavnet i det kristne Norden.
Navnets historie i de danske slægter er tæt forbundet med det gamle bondesamfunds levende patronymtradition, hvor efternavne var flydende og skiftede ved hvert generationsskifte; en søn af en fader ved navn Jakob fik således automatisk efternavnet Jakobsen. Da fornavnet Jakob i århundreder var særdeles populært blandt både det danske borgerskab og bondestanden, var patronymikonet Jakobsen meget hyppigt forekommende i kirkebøgerne. For at skabe administrative, skattetekniske og militære strukturer i samfundet greb statsmagten ind med Navnelovene i 1800-tallet. Dette skete indledningsvist med forordningen af 1828 og endeligt med den skelsættende navnelov af 1856 (ofte omtalt som 1853-loven på grund af sit forarbejde). Loven fastfrøs de eksisterende patronymer permanent, hvorved den slægtleds-specifikke navngivning ophørte, og Jakobsen stivnede som et fast, permanent arveligt slægtsnavn for de efterfølgende generationer.
I det moderne Danmark er Jakobsen et yderst traditionelt og meget almindeligt efternavn. Ifølge officielle opgørelser fra Danmarks Statistik bærer i alt 10.457 danskere efternavnet stavet specifikt som Jakobsen. Hvis det lægges sammen med stavevarianten Jacobsen, som bæres af 21.272 danskere, udgør hele navnestammen det 17. mest udbredte efternavn i landet. Selvom forekomsten af de traditionelle -sen-efternavne over de seneste årtier har vist en svagt faldende tendens – i takt med at nutidige familier søger mod mere unikke mellemnavne eller beskyttede slægtsnavne for at skabe en mere personlig identitet – bevarer Jakobsen sin status som en markant og urokkelig søjle i det danske navnelandskab.
Erhard Jakobsen (1917–2002) var en markant og yderst indflydelsesrig dansk politiker, som i en længere årrække var socialdemokratisk borgmester i Gladsaxe, før han i 1973 stiftede partiet Centrum-Demokraterne (CD) og dermed kom til at spille en helt central og farverig rolle i moderne dansk politisk historie.
Jakob Jakobsen (1864–1918) var en fremtrædende færøsk sprogforsker, filolog og dr.phil., som ydede et uvurderligt og monumentalt videnskabeligt pionerarbejde i kortlægningen af det nordiske sprog og kulturmiljø i Atlanterhavet, herunder med sit banebrydende værk om det nu uddøde norn-sprog på Shetlandsøerne.
Frode Jakobsen (1906–1997) var en fremtrædende dansk modstandsmand, politiker og forfatter, som under anden verdenskrig var en af hovedmændene bag modstandsorganisationen Ringen og efterfølgende spillede en helt central historisk rolle som medlem af Danmarks Frihedsråd samt som minister i Befrielsesregeringen i 1945.
Navnet optræder hos 414 personer.