Efternavnet Frederiksen er et klassisk nordisk patronymikon (et fadersnavn), der ordret betyder "søn af Frederik". Det tilgrundliggende mandsnavn Frederik (historisk også stavet Friderich eller Frederich) er et gammelt germansk navn, som er sammensat af de to ordled frid, som betyder "fred", og rik, som betyder "mægtig", "hersker" eller "fyrste". Den samlede etymologiske og oprindelige betydning af navnestammen tolkes således som "fredshersker" eller "den, der hersker med fred". Navnet blev udbredt over hele Europa via tysk sprogindflydelse i middelalderen og vandt herhjemme tidligt fodfæste pga. sin status som kongenavn.
Navnets historie i de danske slægter afspejler udviklingen af den gamle nordiske patronymtradition, som i århundreder prægede hele det danske samfund. Efter denne skik skiftede efternavnet ved hvert eneste generationsskifte, således at en søn af en fader ved navn Frederik automatisk fik efternavnet Frederiksen, mens en datter blev indskrevet som Frederiksdatter. Siden 1500-tallet har fornavnet været tæt knyttet til det danske kongehus, hvor kongerne skiftevis har heddet Christian og Frederik, hvilket medførte en enorm prestige og udbredelse af fornavnet – først i adelen og senere i den brede landbobefolkning. For at skabe administrative strukturer greb statsmagten ind med Navnelovene i 1800-tallet. Dette skete indledningsvist med forordningen af 1828 og endeligt med den skelsættende navnelov af 1856 (ofte omtalt som 1853-loven på grund af sit forarbejde). Loven fastfrøs de eksisterende patronymer permanent, hvorved den slægtleds-specifikke navngivning ophørte, og Frederiksen stivnede som et fast, permanent arveligt slægtsnavn i de efterfølgende generationer.
I det moderne Danmark er Frederiksen et yderst traditionelt og meget almindeligt efternavn. Ifølge officielle opgørelser fra Danmarks Statistik bærer i alt 29.219 danskere efternavnet Frederiksen. Det placerer Frederiksen solidt som landets 18. mest almindelige efternavn i hele befolkningen. Selvom forekomsten af de traditionelle -sen-efternavne over de seneste årtier har vist en svagt faldende tendens – i takt med at nutidige familier søger mod mere unikke mellemnavne eller beskyttede slægtsnavne – bevarer Frederiksen sin status som en fremtrædende og urokkelig søjle i det danske navnelandskab.
Mette Frederiksen (født 1977) er en markant dansk socialdemokratisk politiker og statskvinde, som skrev historie i 2019 ved at blive Danmarks yngste statsminister nogensinde, og som efterfølgende ledede landet gennem store globale kriser og dannede en sjælden tværpolitisk flertalsregering i 2022.
Kirsten Frederiksen (1914–1998), bedre kendt under sit giftenavn Kirsten Harder, var en fremtrædende dansk svømmer, der opnåede stor national og international anerkendelse i 1930'erne, og som ydede et væsentligt historisk bidrag til dansk elitesport som europamester og olympisk deltager.
Erhard Frederiksen (1843–1903) var en anerkendt dansk agronom, sukkerfabrikant og landøkonomisk forfatter, der spillede en helt central rolle i industrialiseringen af det danske landbrug, og som i eftertiden betragtes som en af hovedmændene bag etableringen af den danske sukkerroeproduktion på Lolland-Falster.
Navnet optræder hos 748 personer.