Emilie er den feminine form af mandsnavnet Emilius, der stammer fra det romerske slægtsnavn Aemilius. Navnet er afledt af det latinske ord aemulus, som betyder "rival" eller "venligtsindet efterligner". Det kom til Danmark via tysk og fransk indflydelse i 1700-tallet.
Navnet vandt først indpas i det borgerlige og adelige miljø i slutningen af 1700-tallet. I løbet af 1800-tallet sivede navnet ud til landalmuen, hvor det blev et yderst populært for- og mellemnavn.
Efter en lang bølgedal i midten af det 20. århundrede vendte navnet Emilie voldsomt tilbage i 1990'erne og 2000'erne, hvor det toppede de officielle navnelister i Danmark.
Emilie Demant Hatt (1873-1958), dansk kunstmaler, forfatter og etnograf, kendt for sit arbejde med samerne. Emilie Ulrich (1872-1952), anerkendt dansk kgl. operasangerinde.
Navnet optræder hos 427 personer.